Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssrp1Q08943 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms