Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms