Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms