Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms