Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms