Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Cnn1Q08091 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Cnn1Q08091 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Cnn1Q08091 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Cnn1Q08091 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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