Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NrepQ07475 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms