Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms