Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms