Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms