Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aplp2Q06335 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aplp2Q06335 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms