Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms