Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top1Q04750 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms