Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms