Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl7Q03366 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms