Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx2Q03358 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx2Q03358 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx2Q03358 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msx2Q03358 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms