Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms