Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp11Q02853 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp11Q02853 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp11Q02853 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp11Q02853 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp11Q02853 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp11Q02853 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp11Q02853 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp11Q02853 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp11Q02853 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp11Q02853 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp11Q02853 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mmp11Q02853 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mmp11Q02853 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms