Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms