Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms