Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms