Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms