Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms