Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms