Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IhhP97812 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IhhP97812 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IhhP97812 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IhhP97812 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IhhP97812 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IhhP97812 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms