Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms