Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms