Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms