Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psme1P97371 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme1P97371 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme1P97371 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme1P97371 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme1P97371 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme1P97371 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme1P97371 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme1P97371 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme1P97371 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme1P97371 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme1P97371 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme1P97371 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme1P97371 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme1P97371 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme1P97371 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psme1P97371 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Psme1P97371 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psme1P97371 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psme1P97371 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Psme1P97371 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psme1P97371 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psme1P97371 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Psme1P97371 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psme1P97371 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Psme1P97371 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Psme1P97371 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psme1P97371 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Psme1P97371 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme1P97371 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psme1P97371 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms