Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll3P85442 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms