Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NyxP83503 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NyxP83503 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NyxP83503 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NyxP83503 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NyxP83503 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NyxP83503 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NyxP83503 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NyxP83503 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NyxP83503 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NyxP83503 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NyxP83503 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NyxP83503 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NyxP83503 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NyxP83503 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NyxP83503 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NyxP83503 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NyxP83503 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms