Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx1P82976 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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