Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Otx2P80206 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx2P80206 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms