Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

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Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1bP70700 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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