Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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