Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tp53bp1P70399 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tp53bp1P70399 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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