Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad50P70388 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad50P70388 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad50P70388 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad50P70388 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad50P70388 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad50P70388 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad50P70388 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms