Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms