Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfixP70257 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfixP70257 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfixP70257 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfixP70257 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfixP70257 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfixP70257 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfixP70257 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfixP70257 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfixP70257 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfixP70257 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfixP70257 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfixP70257 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfixP70257 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfixP70257 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfixP70257 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfixP70257 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfixP70257 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfixP70257 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfixP70257 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfixP70257 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfixP70257 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfixP70257 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfixP70257 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfixP70257 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfixP70257 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfixP70257 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfixP70257 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfixP70257 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfixP70257 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfixP70257 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms