Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hoxd13P70217 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hoxd13P70217 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hoxd13P70217 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hoxd13P70217 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Hoxd13P70217 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Hoxd13P70217 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hoxd13P70217 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hoxd13P70217 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd13P70217 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hoxd13P70217 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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