Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms