Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb4bP68372 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms