Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UbdP63072 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UbdP63072 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
UbdP63072 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
UbdP63072 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
UbdP63072 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UbdP63072 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UbdP63072 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms