Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab1AP62821 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab1AP62821 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab1AP62821 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab1AP62821 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab1AP62821 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab1AP62821 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab1AP62821 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms