Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms