Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms