Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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