Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itga11P61622 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms