Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd6P61407 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms