Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P58686 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P58686 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P58686 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
P58686 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
P58686 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P58686 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P58686 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms